硕士论文相对于本科论文来说有更高的要求，比如本科论文重复率不合格的时候，会被打回修改降重，一般一次就能完成要求，但是硕士论文可能会有两次以上不能通过查重检测的时候，那么硕士论文学校查重两次不过怎么办呢？
硕士论文第一次重复率不能通过，有时候会在答辩委员会的讨论下确定是否有学术不端的行为，没有的，允许送审和答辩，有的，退回修改降重，合格之后再次申请论文送审和答辩；如果两次还是不能通过查重，就会被退回，等待半年之后的再次申请答辩。
就算是硕士论文重复率通过了要求，答辩也通过了，但是硕博论文会有一个抽查的环节，是由教育部完成的，检查出论文有学术不端行为，将会被撤销学位，自己的指导老师也会被追究责任。设置严格的规则就是为了我国学术的进步和知识产权的保护。
硕士论文的查重检测一般选择中国知网中的“知网vip检测系统”，其有独特的数据库，就是“学术论文联合对比库”，收录了除了“全国优秀硕博论文全文数据库”以外的硕博毕业论文，检测的准确程度更高。但是检测价格也在上涨，目前一篇硕士论文的检测价格在五百元左右，让很多同学叫苦不迭，但也无能为力。
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