发布日期:2022-10-24 浏览次数:次 科研问题问AI
细菌基因组的研究策略主要分为DNA 的提取及测序、基因组组装、基因组完成(Genome finishing)、基因预测、基因注释和基因组比较分析六大部分。也有人会写这方面的论文,为此在这给大家分享细菌基因相关的论文文献8篇。
1. 两种表型方法检测产碳青霉烯酶肠杆菌目细菌基因型别的应用价值
摘要:目的 评估改良碳青霉烯灭活试验/乙二胺四乙酸(EDTA)改良碳青霉烯灭活试验(m CIM/e CIM)和碳青霉烯酶抑制剂增强试验检测产碳青霉烯酶肠杆菌目细菌基因型别的临床价值。方法 本研究纳入复旦大学中山医院2020年1-12月耐厄他培南或亚胺培南或美罗培南的190株肠杆菌目细菌,分别用m CIM/e CIM和碳青霉烯酶抑制剂增强试验检测CRE产生的碳青霉烯酶型别,同时使用聚合酶链式反应(PCR)检测结果作为金标准。结果和PCR比较,碳青霉烯酶抑制剂增强试验检测A类丝氨酸碳青霉烯酶的灵敏度98.16%,特异性为100.00%;检测金属β-内酰胺酶的灵敏度为100.00%,特异性为100.00%。m CIM/e CIM检测A类丝氨酸碳青霉烯酶的灵敏度为95.70%,特异性为100.00%;检测金属β-内酰胺酶的灵敏度93.10%,特异性为100.00%,但e CIM试验无法检测同时产A和B类酶的菌株。结论 碳青霉烯酶抑制剂增强试验和m CIM/e CIM方法检测A类丝氨酸碳青霉烯酶和金属β-内酰胺酶都具有较高的灵敏度和特异性。其中碳青霉烯酶抑制剂增强试验操作性更强,并能区分同时产A和B类... 更多
2. 云南省畜禽细菌耐药基因分布特征
摘要:为了解云南省畜禽细菌耐药基因分布特征,采用PCR方法检测94株畜禽细菌中β-内酰胺类、四环素类、磺胺类、大环内酯类、喹诺酮类、氨基糖苷类、磺胺类和氯霉素类共23种耐药基因。结果显示,共检测到23种耐药基因,其中aacA4(90.43%)基因检出率最高,其次是floR(87.23%)、tetA(80.85%)、qnrS(77.66%)、qnrD(74.47%)、tetM(71.28%)、sul2(69.15%)、aadA1(53.19%)、blaTEM(45.74%)、sul1(40.43%)和sul2(38.30%)。携带8种及8种以上耐药基因的菌株比例为73.40%,其中携带耐药基因数最多(14种)的菌株比例为2.13%。地域分布上,保山市畜禽细菌耐药基因的种类(20.00种)和每株细菌平均携带耐药基因数量(11.24种)均高于红河州、昆明市、普洱市和楚雄州;畜禽品种分布上,鸡细菌耐药基因的种类(22.00种)和每株细菌平均携带耐药基因数量(9.11种)均高于猪、牛和羊。本研究结果表明,aacA4、floR、tetA、qnrS、qnrD、tetM、sul2、aa... 更多
3. 利用枯草芽胞杆菌表达系统进行马铃薯抗细菌基因的筛选
摘要:抗菌肽是植物先天免疫系统的重要组成部分,具有良好的广谱抗菌活性,因此作为抗生素的替代品有较好的应用前景。马铃薯野生种(Solanum demissum)作为重要的种质资源,含有丰富的抗性基因。本研究利用指示菌内置文库抗性基因筛选技术,将马铃薯野生种cDNA文库转入指示菌枯草芽胞杆菌内,筛选出两种具有广谱抗菌活性的抗菌肽SdR2332和Sd R2770。我们分别测定了它们的热稳定性、酶稳定性、紫外稳定性、最低抑菌浓度(Minimuminhibitoryconcentration,MIC)和溶血性,旨在明确这两种新抗菌肽的实际可应用性;同时通过测定抗菌肽处理后病原菌活性氧(Reactive oxygen species, ROS)迸发量、进行病原菌细胞形态观察和基因表达分析来探究抗菌肽的抑菌机制及防效。结果表明,抗菌肽SdR2332和SdR2770均具有良好的广谱抗细菌活性,且在低浓度下即可致死病原菌;它们还具有较为稳定的理化性质和较低的溶血性。经抗菌肽SdR2332和SdR2770处理后的青枯菌(Ralstoniasolancearum)出现了明显的活性氧迸发现象,电镜下观察发现其细胞有... 更多
4. 常见细菌基因敲除技术的研究进展
摘要:<正>细菌在自身或外界环境因素的影响下,很容易发生基因突变、变异和重组等不可控的变化,这些变化促进了细菌的进化[1]。而基因是探究细菌结构和功能的基础,因此,利用基因敲除技术验证细菌基因的功能一直是研究的热点。随着对基因探索的不断深入和技术的改进,一系列基因敲除技术相继出现,如锌指核酸酶技术(ZFN技术)、转录激活因子样效应蛋白核酸酶技术(TALEN技术)、自杀性质粒载体系统、Red同源重组技术、CRISPR/Cas等技术。
5. 原料对盐渍泡菜细菌类群及基因功能的影响
摘要:为探究原料对盐渍泡菜中细菌类群产生的影响,采用MiSeq高通量测序技术对两类盐渍泡菜的细菌类群进行比较分析,并采用PICRUSt对其基因功能进行预测。结果显示,发酵沙葱的香农指数、超1指数、Firmicutes(硬壁菌门)、Lactobacillus(乳酸杆菌属)、Pantoea(泛菌属)、Lentibacillus(慢生芽胞杆菌属)和Rahnella(拉恩氏菌属)的相对含量均显著偏高(P<0.05),而菌群能量生产和转换、氨基酸转运与代谢、核苷转运与代谢和转录等功能基因的表达均显著偏低(P<0.05)。分别有68个和2个分类操作单元仅存在于所有发酵沙葱或青椒样品中,累计平均含量分别为8.40%和0.037%。经多元方差分析发现,两类盐渍泡菜细菌类群和基因功能的整体差异均显著(P<0.05)。由此可见,原料对盐渍泡菜的细菌类群与菌群基因功能的表达具有显著的影响。
6. 质粒介导的细菌抗药基因水平转移及应对策略
摘要:<正>据统计,全球畜禽饲用抗生素在2010年超过了6 300万千克[1]。过去的半个多世纪里在人类选择性使用抗生素的压力下,导致细菌耐药基因的快速转移和耐药菌株的急剧增加。为了减轻和控制细菌耐药性的产生和传播,一种有效的方法就是从基因水平上解析细菌产生耐药性以及耐药性传播的分子机制。
7. 肠杆菌科细菌耐药基因表达的遗传和环境调控
摘要:细菌耐药性是21世纪国际关注的重要问题,也是全球面临的重大挑战。肠杆菌科细菌是医院感染的重要病原菌之一。近年来,随着抗生素的大量使用,多种肠杆菌科耐药菌,尤其是多重耐药肠杆菌开始大量出现,对人类健康形成了日益严重的威胁。细菌可以通过耐药基因突变或水平转移的方式获得耐药性,通常情况下,可以通过已知的耐药机制预测相应的耐药表型。然而,最近有研究表明,遗传背景和环境因素能够影响耐药基因的表达,给定的基因型并不一定总是产生预期的耐药表型。这种基因型-表型分离的现象极大程度上限制了从遗传学角度预测耐药表型的能力。文中结合最新文献,从遗传背景和环境条件两个方面探讨了多种肠杆菌科细菌耐药基因的表达调控机制,以期为遗传学预测耐药表型以及临床指导用药提供一定的支持。
8. 污水中耐药细菌及耐药基因去除技术研究进展
摘要:抗生素滥用导致耐药细菌和耐药基因大量产生并广泛存在于各种环境中。在处理含抗生素类废水的过程中,污水处理厂长期承受着抗生素的选择压力,使其成为耐药细菌和耐药基因传播的源和汇,对人体健康和生态安全构成了直接威胁。因此,通过对污水中耐药细菌和耐药基因的高效去除来控制环境中耐药基因传播是目前亟待解决的问题。目前,污水中耐药细菌及耐药基因处理技术主要包括生化处理工艺、物化处理技术。该文综述了多种耐药细菌和耐药基因去除技术的研究进展,包括新兴的噬菌体处理技术,并分析各工艺的去除效果及机制,对今后的研究重点和方向提出建议,为污水深度处理工艺的选择提供借鉴。